Nejdříve je nutno zjistit, zda zemědělská činnost je v souladu s platným územním plánem a stavby k této činnosti byly řádně povoleny. V případě pochybností vydá stanovisko místně příslušný stavební úřad.
Stavební úřad by měl posoudit, zda se vlastník pozemku v daném případě nedopustil přestupku tím, že v rozporu s § 301 odst. 1 zákona č. 283/2021 Sb., stavebního zákona, ve znění pozdějších předpisů (dále jen „stavební zákon“) provedl činnost, ke které je třeba územní rozhodnutí. Dle § 250 stavebního zákona může stavební úřad nařídit i odstranění stavby mimo jiné pokud byla provedena bez povolení podle stavebního zákona anebo v rozporu s ním nebo byla provedena v rozporu s platnou územně plánovací dokumentací.
Pro odstranění nepořádku lze využít postup dle § 66d odst. 1 písm. b) zákona č. 128/2000 Sb., o obcích, ve znění pozdějších předpisů. Fyzická osoba se dopustí přestupku mimo jiné tím, že neudržuje čistotu a pořádek na pozemku, který užívá nebo vlastní, a tím naruší vzhled obce. Za tento přestupek lze uložit pokutu až do 500.000 Kč. Příslušným k řízení je obecní úřad obce s rozšířenou působností.
Pokud je stavba umístěna a zemědělská činnost prováděna v souladu s územním plánem a stavebním zákonem, je ještě možno postupovat podle § 1013 zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník, ve znění pozdějších předpisů. Dle tohoto ustanovení se vlastník mimo jiné zdrží všeho, co působí, že odpad, voda, kouř, prach, plyn, pach, světlo, stín, hluk, otřesy a jiné podobné účinky (imise) vnikají na pozemek jiného vlastníka (souseda) v míře nepřiměřené místním poměrům a podstatně omezují obvyklé užívání pozemku; to platí i o vnikání zvířat. Jsou-li imise důsledkem provozu závodu nebo podobného zařízení, který byl úředně schválen, má soused právo jen na náhradu újmy v penězích, i když byla újma způsobena okolnostmi, k nimž se při úředním projednávání nepřihlédlo. To neplatí, pokud se při provádění provozu překračuje rozsah, v jakém byl úředně schválen.
Tyto spory řeší soudy v občanskoprávním řízení a žalobě musí předcházet písemná výzva, aby se vlastník této činnosti zdržel a odstranil závadný stav s určením přiměřené lhůty.
Doporučuji nejdříve se s vlastníkem a nájemníky sejít a pokusit se o zjednání nápravy dohodou.